Master- und weiterbildende Studiengänge setzen einen ersten, qualifizierten Hochschulabschluss voraus. Sie können daher nicht von Erstsemestern gewählt werden.
Masterstudiengänge dienen der fachlichen und wissenschaftlichen Spezialisierung und können je nach Ausrichtung ein eher anwendungsorientiertes oder forschungsorientiertes Profil aufweisen.
Sog. konsekutive Masterstudiengänge bauen entweder inhaltlich auf einem vorausgehenden Bachelorstudiengang auf, vertiefen also die erworbenen Kenntnisse, oder bieten die Möglichkeit, ergänzende Qualifikationen in einer anderen Fachrichtung zu erwerben.
So kann man z.B. nach einem Bachelorabschluss im Studienfach Physik den entsprechenden Masterstudiengang Physik wählen, um tiefer und vor allem wissenschaftlich forschungsorientiert in die Materie des Faches vorzudringen. Man kann aber auch beispielsweise den Masterstudiengang Journalismus wählen, um entsprechende fachliche und berufspraktische Qualifikationen für das journalistische Arbeitsfeld (z.B. Wissenschaftsjournalismus) zu erwerben. Ein konsekutiver Masterstudiengang gilt zusammen mit einem einschlägigen entsprechenden Bachelorstudiengang als ein grundständiger Studiengang. Deswegen kann ein Studium im konsekutiven Masterstudiengang nach dem BAföG gefördert werden. Die Regelstudienzeit beträgt meist vier Semester.
Weiterbildende Studiengänge setzen neben einem qualifizierten Hochschulabschluss einschlägige praktische Berufserfahrung von mindestens einem Jahr voraus. Die Inhalte des weiterbildenden Masterstudiengangs berücksichtigen hier die beruflichen Erfahrungen und knüpfen an diese an. Die Studiendauer variiert je nach Studienangebot zwischen einem und vier Semestern.
An der JGU werden folgende Masterabschlüsse angeboten: